CISA Imagerie

Chef(s) d'équipe(s) : Romain Morichon

Plateforme d'imagerie CISA

Faculté de Médecine Pierre et Marie Curie
27 rue Chaligny – 75571 PARIS cedex 12

6è étage, pièce 609

Responsables scientifiques
Responsable opérationnel
Gestionnaire

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La plateforme CISA imagerie du centre de recherche St Antoine offrent l'accès à des équipements et expertises nécessaires au soutien de l'activité de recherche en biologie et en santé. Initialement développée pour répondre aux besoins de unité de recherche du centre de recherche St Antoine.

La plateforme est désormais ouverte à l'activité de recherche académique nationale-internationale ainsi qu'au secteur privé.

Créée en 2012, la plateforme CISA répartie sur 2 sites dans l'enceinte de l’hôpital St Antoine à Paris, a pour but de réunir, sous la supervision d'un personnel compétent et formé, un ensemble d'approche technologique et méthodologique nécessaire à la réalisation de vos projets de recherche en biologie et santé.

 

 

Vidéo contarst+fluo.gifContrast Phase+Fluo.jpgPlein champ_mosaique.jpg

Site Faculté de médecine:


Confocal Fluoview3000
- Statif inversé IX83 Evident
- Diodes Lasers 405nm (50mW), 488nm (20mW), 561nm (20mW) et 640nm (40mW)
- 2 détecteurs hautes sensibilités GaASP refroidis
- Détection spectrale
- Platine motorisée avec porte échantillon pour lame lamelle, plaque et boite de pétrie
- Scanner galvanométrique pour la précision et un scanner résonnant (512x512 pixels) pour la vitesse d'acquisition (30 images par seconde en full frame et 430 ips en fenêtré)
- Objectifs :
UPLXAPO 4X ON 0.16 air WD 13mm
UPLXAPO 20X ON 0.8 air WD 0.6mm
UPLSAPO 60X ON 1.35 huile WD 0.15mm
UplanXAPO 100X ON1.45 huile WD 0.13mm
IMG_20230421_104235.jpg

 

Microscope plein champ IX83
-Statif inversé Olympus IX83
- Caméra noir et blanc: Hamamatsu Flash4. Capteur CMOS 2048x2048 pixels, taille du pixel 6,5µm
- Caméra couleur : Olympus SC50. Capteur CMOS 2560x1920 pixels, taille pixel 2,2µm
- Filtres dichroïques Chroma :
« DAPI » excitation 350/50 émission 460/50« EGFP » excitation 480/30 émission 535/40
« Cy3 » excitation 540/25 émission 605/55
« mCherry » excitation 560/40 émission 635/60
« Cy5 » excitation 620/50 émission 690/50
« Cy5 Fish » excitation 640/30 émission 690/50
- Sources lumineuses : Cool LED PE-4000 permet d’avoir des raie d’excitation modulable
- Logiciel : Cell sens dimension V1.16 + module Count and mesure + module deconvolution
- Objectifs :
UPLXAPO 4X ON 0.16 air WD 13mm
UPLFLN 10X air 0,30 WD 10mm
LUCPLFLN 20X air 0,45 WD 6,6 à 7,8 mm bague correctrice
LUCPLFLN 40X air 0,6 WD 62,7 à 4 mm bague correctrice
UPLSAPO 60XS2 Silicone WD 0,3 mm
- Platine Motorisée en XY : possibilité de multi-position, mosaïque, scann de lame
- Chambre CO2 : Pecon cell vivo
- Chambre thermostatée : Pecon cell vivo
IMG_0002.JPG

Station analyse Située pièce 608

PC Intel XEON Silver 4208 2,1GHz
192 Go RAM
GPU Nvidia RTX A4500 20Go
Logiciel installé
-Imaris 10,2 https://imaris.oxinst.com/
-Qupath 0,51 avec extension Stardist, cellpose, SAM https://qupath.github.io/
-Cellpose https://github.com/MouseLand/cellpose
-Fiji https://fiji.sc/
-Ilastik https://www.ilastik.org/
-Olyvia
-Cellsens dimension 1.18
-CytoMAP https://gitlab.com/gernerlab/cytomap
-Cellprofiler 2.0 https://cellprofiler.org/
-Microscopy Image Browser (MIB) https://mib.helsinki.fi/
-Napari https://napari.org/
-Microsocpic image analyzer https://mianalyzer.github.io/introduction/intro.html

 

Site Kourilsky:

Scanner de lame SlideView VS200 Evident
- Acquisition en brightfield et fluorescence DAPI, FITC, Cy3, Cy5 et Cy7
- Objectifs disponibles :
overview PLN2X et UPFLN4X
acquisition UPLXAPO20X, UPLXAPO40X et UPLXAPO60X huile
- Chargeur automatique de plateau 5 de disponible
Scanner (2).jpg
Microscope plein champ IX83
- Statif inversé Evident IX83
- Cube filtre disponible DAPI, FITC, Texas Red, CY5
- Caméra olympus DP74 CMOS Caméra 12 bits Résolution max 1920x1200 pixel Taille des pixels 5.86µmx5.86µm
- Platine Motorisée en XY : possibilité de multi-position, mosaïque, scann de lame
- Boitier LED PE-300- Objectifs:
UPLFLN 4X ON 0.13 PH WD 17mm
UPLFLN 10X ON 0.3 PH WD 10mm
UPLFLN 20X ON 0.45 PH WD 6.6 à 7.38mm bague de correction
UPlanPLN 40X ON 1,3 huile WD 0.51mm
UPlanSAPO 60X ON 1,35 huile WD 0.15mm
UPlanSAPO100X ON 1,4 huile WD 0.12mm
IMG_20250410_145203.jpg
Microscope plein champ BX43
- Microscope droit Evident SEMI motorisé BX43
- Cube filtre disponible DAPI, FITC, Texas Red, CY5
- Caméra olympus DP28 CMOS Résolution max 4104x2174 pixels taille des pixels 3.45x3.45µm
- Boitier LED PE-300
- Objectifs
4X ON 0,13 Ph1 UPlanFL
10X ON 0,3 Ph1 UPlanFL
20X ON 0,5 UPlanFL
40X ON 0,75 UPlanFL
60 X ON 0,9 UPlanFL
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Evos M5000
- Statif inversé pour lame et plaque
- Filtre :
DAPI excitation 357/44 émission 447/60
GFP excitation 470/22 émission 525/50
RFP excitation 531/40 émission 593/40
- Possibilité de visualiser des images en contraste de phase, brightfield et couleur
- Objectifs:
4X ON 0,13 Ph
10X ON 0,3
20X ON 0,45
40X ON 0,65
IMG_20250410_145250.jpg

 

 

 

Bioorthogonal Postlabeling Reveals Nuclear Localization of a Highly Cytotoxic Half-Sandwich Ir(III) Tetrazine Complex in Live Cells. Annunziata A, Amhaz S, Forté J, Gontard G, Morichon R, Sobczak-Thépot J, Salmain M.
Chembiochem. 2025 Apr 3:e2500090. doi: 10.1002/cbic.202500090. Online ahead of print.
PMID: 40178169

Intricate ribosome composition and translational reprogramming in epithelial-mesenchymal transition.
Morin C, Baudin-Baillieu A, Van Long FN, Isaac C, Bidou L, Arbes H, François P, Pommier RM, Adrait A, Saku A, Gran-Ruaz S, Machkouri C, Vanbelle C, Morichon R, Boissan M, Catez F, Ferrari A, Morel AP, Couté Y, Chat S, Giudice E, Gillet R, Puisieux A, Moyret-Lalle C, Diaz JJ, Namy O, Marcel V.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Dec 10;121(50):e2408114121. doi: 10.1073/pnas.2408114121. Epub 2024 Dec 5.
PMID: 39636864

Targeting cholangiocarcinoma cells by cold piezoelectric plasmas: in vitro efficacy and cellular mechanisms.
Soulier M, Lekbaby B, Houari I, Decauchy H, Pavy A, Coumes A, Morichon R, Dufour T, Fouassier L.
Sci Rep. 2024 Dec 4;14(1):30178. doi: 10.1038/s41598-024-81664-9.
PMID: 39632956

Ciliopathy due to POC1A deficiency: clinical and metabolic features, and cellular modeling.
Perge K, Capel E, Villanueva C, Gautheron J, Diallo S, Auclair M, Rondeau S, Morichon R, Brioude F, Jéru I, Rossi M, Nicolino M, Vigouroux C.
Eur J Endocrinol. 2024 Feb 1;190(2):151-164. doi: 10.1093/ejendo/lvae009.
PMID: 38245004

PARP Inhibitor Inhibits the Vasculogenic Mimicry through a NF-κB-PTX3 Axis Signaling in Breast Cancer Cells.
Chivot J, Ferrand N, Fert A, Van Dreden P, Morichon R, Sabbah M.
Int J Mol Sci. 2022 Dec 18;23(24):16171. doi: 10.3390/ijms232416171.
PMID: 36555812

WISP2/CCN5 Suppresses Vasculogenic Mimicry through Inhibition of YAP/TAZ Signaling in Breast Cancer Cells.
Ferrand N, Fert A, Morichon R, Radosevic-Robin N, Zaoui M, Sabbah M.
Cancers (Basel). 2022 Mar 14;14(6):1487. doi: 10.3390/cancers14061487.
PMID: 35326638

Portal fibroblasts with mesenchymal stem cell features form a reservoir of proliferative myofibroblasts in liver fibrosis.
Lei L, Bruneau A, El Mourabit H, Guégan J, Folseraas T, Lemoinne S, Karlsen TH, Hoareau B, Morichon R, Gonzalez-Sanchez E, Goumard C, Ratziu V, Charbord P, Gautheron J, Tacke F, Jaffredo T, Cadoret A, Housset C.
Hepatology. 2022 Nov;76(5):1360-1375. doi: 10.1002/hep.32456. Epub 2022 Mar 29.
PMID: 35278227

MRCK-Alpha and Its Effector Myosin II Regulatory Light Chain Bind ABCB4 and Regulate Its Membrane Expression.
Bruneau A, Delaunay JL, Durand-Schneider AM, Vauthier V, Ben Saad A, Aoudjehane L, El Mourabit H, Morichon R, Falguières T, Gautheron J, Housset C, Aït-Slimane T.
Cells. 2022 Feb 10;11(4):617. doi: 10.3390/cells11040617.
PMID: 35203270

Cytotoxic BODIPY-Appended Half-Sandwich Iridium(III) Complex Forms Protein Adducts and Induces ER Stress.
Ramos R, Gilles JF, Morichon R, Przybylski C, Caron B, Botuha C, Karaiskou A, Salmain M, Sobczak-Thépot J.
J Med Chem. 2021 Nov 25;64(22):16675-16686. doi: 10.1021/acs.jmedchem.1c01335. Epub 2021 Nov 11.
PMID: 34761949

Effect of Monoclonal Antibody Blockade of Long Fragment Neurotensin on Weight Loss, Behavior, and Metabolic Traits After High-Fat Diet Induced Obesity.
Wu Z, Stadler N, Abbaci A, Liu J, Boullier A, Marie N, Biondi O, Moldes M, Morichon R, Feve B, Melander O, Forgez P.
Front Endocrinol (Lausanne). 2021 Oct 8;12:739287. doi: 10.3389/fendo.2021.739287. eCollection 2021.
PMID: 34690932

Progerin Expression Induces Inflammation, Oxidative Stress and Senescence in Human Coronary Endothelial Cells.
Bidault G, Garcia M, Capeau J, Morichon R, Vigouroux C, Béréziat V.
Cells. 2020 May 12;9(5):1201. doi: 10.3390/cells9051201.
PMID: 32408587

The Integrase Inhibitors Dolutegravir and Raltegravir Exert Proadipogenic and Profibrotic Effects and Induce Insulin Resistance in Human/Simian Adipose Tissue and Human Adipocytes.
Gorwood J, Bourgeois C, Pourcher V, Pourcher G, Charlotte F, Mantecon M, Rose C, Morichon R, Atlan M, Le Grand R, Desjardins D, Katlama C, Fève B, Lambotte O, Capeau J, Béréziat V, Lagathu C.
Clin Infect Dis. 2020 Dec 17;71(10):e549-e560. doi: 10.1093/cid/ciaa259.
PMID: 32166319

Novel defatting strategies reduce lipid accumulation in primary human culture models of liver steatosis.
Aoudjehane L, Gautheron J, Le Goff W, Goumard C, Gilaizeau J, Nget CS, Savier E, Atif M, Lesnik P, Morichon R, Chrétien Y, Calmus Y, Scatton O, Housset C, Conti F.
Dis Model Mech. 2020 Apr 29;13(4):dmm042663. doi: 10.1242/dmm.042663.
PMID: 32094147

Functional Human Beige Adipocytes From Induced Pluripotent Stem Cells.
Guénantin AC, Briand N, Capel E, Dumont F, Morichon R, Provost C, Stillitano F, Jeziorowska D, Siffroi JP, Hajjar RJ, Fève B, Hulot JS, Collas P, Capeau J, Vigouroux C.
Diabetes. 2017 Jun;66(6):1470-1478. doi: 10.2337/db16-1107. Epub 2017 Mar 7.
PMID: 28270520

Expression of the transcriptional regulator snail1 in kidney transplants displaying epithelial-to-mesenchymal transition features.
Xu-Dubois YC, Galichon P, Brocheriou I, Baugey E, Morichon R, Jouanneau C, Ouali N, Rondeau E, Hertig A.
Nephrol Dial Transplant. 2014 Nov;29(11):2136-44. doi: 10.1093/ndt/gft279. Epub 2013 Sep 15.
PMID: 24042020

Lipodystrophy-linked LMNA p.R482W mutation induces clinical early atherosclerosis and in vitro endothelial dysfunction.
Bidault G, Garcia M, Vantyghem MC, Ducluzeau PH, Morichon R, Thiyagarajah K, Moritz S, Capeau J, Vigouroux C, Béréziat V.
Arterioscler Thromb Vasc Biol. 2013 Sep;33(9):2162-71. doi: 10.1161/ATVBAHA.113.301933. Epub 2013 Jul 11.
PMID: 23846499

Nouvel utilisateur

Prise de contact par mail à l'adresse romain.morichon@sorbonne-universite.fr ou par téléphone au 01 40 01 13 19.

Création d'un compte openIris obligatoire pour réserver les équipements.

Une fois le comptre crée:

Dans ressources, dans le filtre provider, choisir "CISA imagerie"

Visualisation du planing de réservation OpenIRIS

Calcul de la facturation

La plateforme est en autofinancement. Les tarifs sont calculés à partir des coûts complets et validés par le conseil d’administration de Sorbonne Universié.

Annulation, défection et retard

Si vous ne vous présentez pas à l’heure de réservation sans avoir annulé vous serez facturé de la totalité de votre réservation.

 

Tarif 2024* Imagerie: coût horaire (€HT)
Prestation (UO) Coût complet d'une unité d'oeuvre (HT UO) Tarif SU (HT UO) Tarif public hors SU (HT UO) Tarif privé / entreprise
Acquisition confocale (9h-18h) (heure) 281.4€ 20€ 45€ Sur devis
Acquisition IX83 Faculté (9h-18h) (heure) 35.98€ 2€ 8€ Sur devis
Acquisition confocale (18h-9h) (heure) 43.88€ 10€ 35€ Sur devis
Acquisition IX83 Faculté (18h-9h) (heure) 6.90€ 1€ 4€ Sur devis
Acquisition Scanner (heure)   7€ 10€ Sur devis
Imaris (heure) 23.3 7€ 21€ Sur devis

*Validation par CS de SU

Partenaires :

SU.pngINSERM.pnglogo_ibisa.pngimage11.pngplan_cancer_2014_2019.jpg

Membre du Réseau LUMIC de plateformes de Sorbonne Université

Label :

Gis-IBiSA Plateforme LUMIC

Coordonnées :
Romain Morichon (responsable opérationnel)

Plateforme d'imagerie (CISA-Imagerie)
Centre de Recherche Saint Antoine

Sorbonne Université - Faculté de Santé
Campus Saint-Antoine
27 rue Chaligny
75012 PARIS

6è étage, pièce 609
Tél. : 01 40 01 13 19

Moyen d’accèsCapture d’écran 2025-04-17 151126.png

Métro

ligne8.png : Faidherbe-Chaligny

ligne 1.png : Reuilly Diderot

Bus

Ligne 46bus.png ou 86bus.png : Faidherbe-Chaligny

Ligne 57bus.png : Hôpital Saint-Antoine

Hôpital St-Antoine

Bâtiment Kourilsky
34 rue Crozatier
75012 PARIS

Sorbonne Université
27 rue Chaligny
75012 PARIS

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