Plateforme de Cytométrie CISA
Faculté de Médecine Pierre et Marie Curie
27 rue Chaligny – 75571 PARIS cedex 12
6è étage, pièce 608
medecine-cisa-cytometrie@listes.sorbonne-universite.fr
CISA Cytométrie à Saint-Antoine propose des technologies de pointe pour l'analyse cellulaire, le tri cellulaire, la caractérisation des nanoparticules et également l'analyse cellulaire en temps réel sans marquage exogène par la technologie xCELLigence RTCA. Profitez d'une expertise en analyse multiparamétrique des données de cytométrie, incluant des outils d'analyse hiérarchique supervisée, non supervisée, ainsi que des algorithmes automatisés de réduction de dimension et de clusterisation.
La plateforme est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique publique ou privée.
Cytométrie en flux dédiée aux projets de recherche nécessitant des analyses et/ou du tri de populations cellulaires et de fractions subcellulaires : cellules animales ou végétales, micro-organismes d’origine variée. La plateforme son expertise au service des utilisateurs dans des domaines variés (analyse du cycle cellulaire et de l’apoptose, tri de cellules rares, tri multiparamétrique). Nos missions sont d’adapter les développements méthodologiques de la plate-forme de cytométrie en relation avec les projets des utilisateurs.
RTCA xCELLigence, développée par la société ACEA Biosciences, permet de suivre l’activité cellulaire en temps réel et en continu 24h/24h sans marquage préalable. Alliance de la microélectronique et de la biologie cellulaire, cette technologie est basée sur une mesure d'impédance. - Les cellules poussent sur un support de microélectrodes d’or et en modifient le flux électronique. La mesure d’impédance des cellules permet d’obtenir des informations quantitatives sur l’état biologique cellulaire (adhésion, prolifération, viabilité, morphologie…). Elle permet d’appréhender et de suivre dans son ensemble l’activité cellulaire sur plusieurs jours, identifiant des variations très fines des capacités prolifératives, adhésives… des cellules étudiées que le phénomène soit précoce ou tardif.
Analyses Multiparamétriques
Transfert de connaissances. Nos missions sont d’adapter les développements méthodologiques de la plate-forme en relation avec les projets des utilisateurs, de proposer des activités de formation théorique et technique du domaine auprès des scientifiques, des étudiants et des personnels en stage de formation continue. Nous maintenons une veille technologique associée à la montée en compétence de l’offre de service et proposons un catalogue de formations (Cf onglet équipement)
La plateforme CISA Cytométrie est dotée des équipements suivants :
• xCELLigence Real Time Cell Analyser DP (Agilent)
Le système DP est capable de mesurer séparement simultanément trois plaques de 16 puits (E-Plate 16)
Il permet également les mesures de migration et d’invasion cellulaire avec les plaques CIM (CIM-Plate 16)
Enregistrement des mesures et exploitation des données par le RTCA Software Pro.pdf
Les E-plates, à usage unique, ont les mêmes caractéristiques en terme de configuration et de volume des puits qu’une micro-plaque de culture cellulaire standard. Leur particularité réside dans l’incorporation de capteurs qui sont implantés au fond de chaque puits. Il s’agit de micro-électrodes en or qui servent à contrôler et mesurer les modifications d’impédance électrique. Elles couvrent 80% du puits. Vous avez le choix entre un support en verre ou un support en plastique (cf le site Agilent).
Il existe une version modifiée, E-Plate view, pour laquelle le réseau de micro-électrodes couvre 70% de la surface de chaque puits. Cela permet de créer une fenêtre de visualisation des cellules qui peuvent être imagées sous microscope photonique. Les mesures d’impédance cellulaires sont identiques à celles obtenues avec les E-Plate standards.
Les CIM Plate. Contrairement aux méthodes conventionnelles, l’utilisation des CIM-Plate fournit des informations cinétiques sur la migration cellulaire en enregistrant de façon dynamique l'ensemble du processus de migration et d'invasion cellulaire en temps réel sans marquage des cellules. La CIM-Plate (invasion/migration cellulaire), comporte des capteurs micro-électriques intégrés sur la face inférieure de la membrane microporeuse en polyéthylène téréphtalate d'une chambre de type Boyden.
Lorsque les cellules migrent de la chambre supérieure à travers la membrane vers la chambre inférieure en réponse au chimio-attractant, elles entrent en contact et adhèrent aux capteurs situés sous la membrane, ce qui entraîne une augmentation de l'impédance. L'augmentation de l'impédance est corrélée au nombre croissant de cellules migrées sur la face inférieure de la membrane, et les valeurs d'indice cellulaire reflétant les changements d'impédance sont enregistrées automatiquement et en continu par l'instrument. L'activité de migration cellulaire peut être surveillée via le profil d'indice cellulaire.
• Cytomètre analyseur Novocyte Quantéon (Agilent)
4 Laser (VBJR) 100 mW. 25 détecteurs (Silicium) de fluorescence (Config.pdf)
Passeur haut débit pour tubes (40 positions) ou microplaques
Sample recovery
Quantification absolue directe
• Cytomètre trieur
En attente de financement
• Analyses multiparamétriques
• Catalogue de formations CISA
Formation Analyse de données non supervisées en cytométrie
Objectifs :
- Connaitre et appréhender l’analyse des données multiparamétriques
- Mettre en évidence la complémentarité des logiciels et des algorithmes
- Utilisation des algorithmes : t-SNE, UMAP, SPADE, FlowSOM, ClusterX, phenograph, HeatMap, VulcanoPlot, analyse supervisée par machine learning
- Créer un pipeline d’analyse pour répondre à une question biologique.
Analyse de données de cytométrie : FlowJo X
Objectifs :
- Utiliser FlowJo et ses fonctions de base
- Présentation des données : graphiques, overlays, batch et système d’itération
- Tables statistiques : création et batch
- Système d’exportation des données et des graphiques
- Les compensations
- Manipuler et savoir analyser des fichiers de données multiparamétriques
- Utiliser les analyses booléennes.
• Logiciels d'analyse disponible sur la plateforme : NovoExpress, Kaluza, VenturiOne, FlowJo, OMIQ, CytoBank, RTCA Pro
• Logiciels d'analyse disponible à la location : OMIQ, CytoBank
• Station d'analyse
Accès, dans les locaux de la plateforme, à un PC double écrans, disponible gratuitement sous réservation (OpenIris),
• Laboratoire de culture L1
PSM type2 (Thermo)
incubateur à CO2 (Sanyo)
Réfrigérateur/congélateur
Microfuge 22R (Beckman Coulter)
Centrifugeuse Allegra (Beckman Coulter)
Cell cycle-dependent mRNA localization in P-bodies
Adham Safieddine, Marie-Noëlle Benassy, Thomas Bonte, Floric Slimani , Oriane Pourcelot, Michel Kress, Michèle Ernoult-Lange, Maïté Courel, Emeline Coleno, Arthur Imbert, Antoine Laine, Annie Munier Godebert, Angelique Vinit, Corinne Blugeon, Guillaume Chevreux, Daniel Gautheret, Thomas Walter, Edouard Bertrand, Marianne Bénard, Dominique Weil
PMID: 39368464 DOI: 10.1016/j. molcel.2024.09.011
GCD57+ EMRA CD8+ T cells in cancer patients over 70: associations with prior chemotherapy and response to anti-PD-1/PD-L1 therapy
Cécile Gonnin, Michelle Leemans, Florence Canoui-Poitrine, Morgane Lebraud, Aurélien Corneau, Louise Roquebert, Philippe Caillet, Pierre Gay, Johanna Canovas, Axelle Histe, Catherine Blanc, Carine El-Sissy, Anis Larbi, Johanne Poisson, Pauline Ober, Pascaline Boudou-Rouquette, Pierre-André Natella, Hélène Vallet, Besma Saadaoui, Richard Layese, Eric Tartour, lena Paillaud, Clémence Granier
PMID: 39731117 PMCID: PMC11673364 DOI: 10.1186/s12979-024-00487-4. Immun Ageing. 2024 Dec 27;21(1):89
Les Colorants de viabilité.pdf
BD Horizon-DS-Fixable-Viability-Stain-Reagents.pdf
Les kits de fixation/perméabilisation
Les billes de compensation
BC Life Sciences VersaComp Antobody Capture Beads
Thermofischer Scientific UltraComp eBeads
Thermofisher Scientific abc total antibody compesation
Les spectraviewer
BD Fluoroscence spectrum viewer
BioLegend Fluorescence Spectra Analizer
Cell Migration Assay with xCELLigence DP a hands-on video (5 minutes)
Cell Adhesion Assay with iCELLigence - a hands on video (5 minutes)
RTCA_DP_System_Operator_Manual_v3.pdf
Agilent Cell Analysis Webinar series
Nouvel utilisateur
Prise de contact par mail à l'adresse medecine-cisa-cytometrie@listes.sorbonne-universite.fr ou par téléphone au 01 40 01 13 68.
Suite à la prise de contact un rendez-vous sera fixé afin de discuter de votre projet. A cette occasion, vous devrez prendre connaissance de la charte et du réglèment intérieur du service et différents documents devront être remplis.
Charte CISA Cytométrie.pdf
2021 Règlement intérieur CISA Cytométrie.pdf
Note d'information travail isolé Faculté de médecine Sorbonne Université.docx
Fiche projet.docx
Fiche évaluation des risques.docx
Visualisation du planing de réservation OpenIRIS
Calcul de la facturation
La plateforme est en autofinancement. Les tarifs sont calculés à partir des coûts complets et validés par le conseil d’administration de Sorbonne Universié.
La tarification pour les analyseurs est calculée en fonction de l’heure de connexion et de déconnexion à la session de l’utilisateur. Le minimum de facturation est 30 minutes.
La tarification pour le trieur est calculée à partir de l’arrivée sur la plateforme. Le clonage est facturé pour une heure minimum.
Annulation, défection et retard
Si vous ne vous présentez pas à l’heure de réservation sans avoir annulé vous serez facturé de la totalité de votre réservation.
Analyseurs : vous pouvez annuler sans pénalité une heure avant le début de la réservation. Si vous dépassez votre créneau de réservation, vous devrez laisser la place à l’utilisateur suivant. Un analyseur laissé allumé toute la nuit, l’utilisateur sera facturé 50% du temps pendant lequel le système sera resté allumé.
Trieur : vous pouvez annuler sans pénalité vingt quatre heures avant votre rendez-vous. Si vous arrivez avec plus d’une heure de retard sans prévenir la plateforme, le personnel peut annuler le tri. PAS de TRIEUR disponible pour le moment.
RTCA-xCELLigence :
Vous pouvez annuler sans pénalité vingt quatre heures avant votre rendez-vous. Si vous arrivez avec plus d’une heure de retard sans prévenir la plateforme, le personnel peut annuler le rendez-vous. Si vous ne vous présentez pas à l’heure de réservation sans avoir annulé vous serez facturé le tarif de la plaque et le tarif location.
Tarifs_2024_CISA-Cytométrie.pdf
| Tarif 2024* | Cytométrie en flux : coût horaire (€ HT) | |||||||
| Tarif SU |
Tarif Académique hors SU |
Tarif Industriel | ||||||
| Technologie | Sans prestation | Avec prestation | Sans prestation | Avec prestation | Sans prestation | Avec prestation | ||
| Trieur | ||||||||
| Analyseur | ||||||||
| Tamis stérile | 5 | Sur devis | ||||||
| xCELLigence coût/Plate (€ HT) | ||||||||
| E Plate 16 (PET) | 42 | 42 | Sur devis | |||||
| CIM Plate | 127 | 127 | Sur devis | |||||
| xCELLigence location emplacement/Plate (€ HT) | ||||||||
| xCELLigence DP | 24 | 31 | Sur devis | |||||
| Analyse de données 4H (€ HT) | ||||||||
| Prestation | 50 | 80 | Sur devis | |||||
|
Location logiciels (Omiq et CytoBank) |
15 | 30 | Sur devis | |||||
*Validation par CS de SU
Le congrès de l'International Society for Advancement of Cytometry se tiendra du 31 mai au 4 juin 2025 à Denver (Colorado).
CYTO 2025, the 38th annual Congress of the International Society for the Advancement of Cytometry will be the premier, inclusive, and international conference on the many facets of cytometry science and engineering. Join us at this year’s conference in Denver, Colorado! It’s known for its warm hospitality, thriving cultural scene, diverse neighborhoods, and natural beauty that combine to create one of the world’s most spectacular cities. Home to cutting-edge research institutions and a thriving life science industry, the city is a hub for biomedical research, with leading academic institutions and research hospitals. Embodying the “Mile High” city’s breathtaking views and dedication to research will allow for a 2025 CYTO focused exploring the diverse range of scientific interest in Cytometry.
Le congrès annuel de l'Association Française de Cytométrie se tiendra du 25 au 28 novembre 2025 à Dijon (France).
AFC 2025. Outre le patrimoine historique, culturel et gastronomique, vous pourrez découvrir la production scientifique régionale. Elle est très diverse et pluridisciplinaire touchant les domaines de la santé, de l’agro-alimentaire et de la nutrition, de la microbiologie, de la vigne et du vin et de la décarbonation. Le programme scientifique du congrès, développera les thématiques de la cytométrie, de l’imagerie, l’immunologie fondamentale et clinique, l’hématologie, les thérapies cellulaires, les nanoparticules, les microvésicules et la microbiologie.
Partenaires :
INSERM 
Sorbonne Université 
Membre du Réseau LUMIC de plateformes de Sorbonne Université
Label :
Coordonnées :
Dr Aurélien Corneau (co-responsable opérationnel)
Annie Munier (co-responsable opérationnel)
Plateforme de Cytométrie (CISA-Cyto)
Centre de Recherche Saint Antoine
Faculté Pierre et Marie Curi
27 rue Chaligny
75012 PARIS
6è étage, pièce 608
Tél. : 01 40 01 13 68
medecine-cisa-cytometrie@listes.sorbonne-universite.fr
Moyen d’accès
Métro
Ligne 8 : Faidherbe-Chaligny
Ligne 1 : Reuilly Diderot
Bus
Ligne 46 ou 86 : Faidherbe-Chaligny
Ligne 57 : Hôpital Saint-Antoine
Bâtiment Kourilsky
34 rue Crozatier
75012 PARIS
Sorbonne Université
27 rue Chaligny
75012 PARIS
